Клеткадан өтүүчү пептиддер клетка мембранасына оңой өтө турган кичинекей пептиддер.Молекулалардын бул классы, өзгөчө максаттуу функциялары бар CPPs, максаттуу клеткаларга натыйжалуу дары жеткирүү үчүн убада берет.
Ошондуктан, бул боюнча изилдөө белгилүү бир биомедициналык мааниге ээ.Бул изилдөөдө, ар кандай трансмембраналык активдүүлүккө ээ CPPs ырааттуулук деңгээлинде изилденип, КППнын трансмембраналык активдүүлүгүнө таасир этүүчү факторлорду, ар кандай активдүүлүгү бар CPPs жана NonCPPs ортосундагы ырааттуулук айырмачылыктарын табууга аракет кылышкан жана биологиялык ырааттуулуктарды талдоо ыкмасын киргизген.
CPPs жана NonCPPs ырааттуулугу CPPsite маалымат базасынан жана ар кандай адабияттардан алынган, ал эми жогорку, орто жана төмөн трансмембраналык активдүүлүгү бар трансмембрандык пептиддер (HCPPs, MCPPs, LCPPs) маалымат топтомун түзүү үчүн CPPs ырааттуулугунан алынган.Бул маалыматтар топтомдорунун негизинде, төмөнкү изилдөөлөр жүргүзүлдү:
1, ар кандай активдүү CPPs жана NonCPPs аминокислота жана экинчи структуралык курамы ANOVA тарабынан талдоого алынган.Аминокислоталардын электростатикалык жана гидрофобдук өз ара аракеттешүүсү КППнын трансмембраналык активдүүлүгүнө маанилүү роль ойной тургандыгы аныкталды, ал эми спираль түзүлүшү жана туш келди оролуу CPPтердин трансмембраналык активдүүлүгүнө да таасирин тийгизген.
2. Эки өлчөмдүү тегиздикте ар кандай иш-аракеттери бар КППнын физикалык жана химиялык касиеттери жана узундугу көрсөтүлдү.Ар кандай иш-аракеттери бар CPPs жана NonCPPs кээ бир өзгөчө касиеттер боюнча кластердик болушу мүмкүн экени аныкталды жана HCPPs, MCPPs, LCPPs жана NonCPPs үч кластерге бөлүнүп, алардын айырмачылыктарын көрсөтүштү;
3. Бул эмгекте биологиялык ырааттуулуктун физикалык жана химиялык центроиддери түшүнүгү киргизилип, ырааттуулукту түзгөн калдыктар бөлүкчөлөрдүн чекиттери катары каралат, ал эми ырааттуулук изилдөө үчүн бөлүкчөлөр системасы катары абстракцияланат.Бул ыкма ар кандай иш-аракеттери бар КППны 3D тегиздигине PCA ыкмасы менен проекциялоо аркылуу КППны талдоодо колдонулган жана көпчүлүк CPPs чогуу кластерленгени жана кээ бир LCPPs NonCPPs менен бирге кластерленгени аныкталган.
Бул изилдөө КППны долбоорлоо жана ар кандай иш-аракеттер менен КППнын ырааттуулугундагы айырмачылыктарды түшүнүү үчүн таасирин тийгизет.Мындан тышкары, бул макалада киргизилген биологиялык тизмектердин физикалык жана химиялык центроидинин анализ ыкмасы башка биологиялык маселелерди талдоо үчүн да колдонулушу мүмкүн.Ошол эле учурда, алар кээ бир биологиялык классификация көйгөйлөрү үчүн кириш параметрлери катары колдонулушу мүмкүн жана үлгү таанууда ролду ойнойт.
Посттун убактысы: 15-июнь-2023